Na replicação do MySQL, um escravo "sincroniza" seus dados do log de transações do mestre, não diretamente do banco de dados. O escravo armazena a última posição nesse log de transações, portanto, desde que você não tenha tocado nesse número de posição no escravo, assim que ele se tornar ativo novamente, ele continuará a executar as transações daquela posição em que parou. Tudo deve estar bem para você.
Aqui você vai, para sua referência: link