A partir dos documentos mod_headers :
As diretivas fornecidas pelos mod_headers podem ocorrer em praticamente qualquer lugar dentro da configuração do servidor. Eles são válidos nas seções principal de configuração do servidor e host virtual, dentro e seções, e dentro dos arquivos .htaccess.
Se você quiser que isso se aplique a todo o vhost, por que colocá-lo dentro de <Location>
tags? Basta colocar as diretivas dentro da configuração principal do vhost.
<VirtualHost *:80>
ServerAdmin [email protected]
ServerName example.com
ServerAlias www.example.com
DocumentRoot /home/deploy/public_html/railsapp/current/public
LogLevel warn
ErrorLog /home/deploy/public_html/railsapp/shared/log/error.log
CustomLog /home/deploy/public_html/railsapp/shared/log/access.log combined
<IfModule mod_headers.c>
Header unset X-Runtime
Header unset X-Powered-By
</IfModule>
</VirtualHost>
Eu não testei este pedido de desculpas antecipadamente se estiver incorreto.