O consul, o zookeeper e o etcd se concentram em fornecer armazenamento durável confiável para quantidades limitadas de dados, mesmo no contexto de cenários de falha, como instâncias perdidas e partições de rede. Eles agem como a "fonte da verdade" para dados de configuração críticos dos quais grandes infraestruturas dependem.
O Mongo é uma fera completamente diferente. Ele também tem algumas funções de cluster e failover, mas sua confiabilidade e durabilidade frente a problemas é significativamente menos robusta.
Então, se é uma boa idéia depende do seu caso de uso, mas se alguém estava usando um dos etcd, consul ou zookeeper para o propósito pretendido, nunca os substituiria pelo mongo.
A inigualável série Call Me Maybe de Kyle Kingsbury entra em detalhes sobre o comportamento de vários sistemas de banco de dados em condições difíceis:
Todos os itens acima e muitos outros são abordados. Altamente recomendado.