Eu não faria praticamente o que você quer fazer.
- Não instale o Exchange em um controlador de domínio. Ponto final.
- Definitivamente, não instale em dois controladores de domínio.
- Por favor, leia sobre o Active Directory. Se você ainda, em Twenty-By-God-Fourteen, acha que existem Primary Domain e Backup Domain Controllers, estou com medo de que outros mal-entendidos você tenha.
- Dois CDs são uma ideia sensata, absolutamente.
- Se este for o hardware atual, você estará desperdiçando muitos recursos. Olhe para o Hyper-V ou o VMware ESXi; todas as máquinas que você deseja seriam ótimas como convidados da VM.
- Se você tem o orçamento para uma empresa de serviços gerenciados, por que não os contrata agora para ajudar a criar isso? Custará mais se eles precisarem pesquisar e corrigir um projeto ruim. Coloque-os em agora .
- Para 40 usuários, eu preferiria ir com o Office 365 Hosted Exchange ou com a oferta hospedada do Exchange de outra pessoa.
- Se você está pronto para o Exchange, aprenda rápido e bom (improvável) ou contrate um profissional. Mesmo que o item 3 e 6, realmente.
- Não vejo nada aqui sobre um servidor para hospedar seus backups. Por que é que? - Espere, eu vejo que você mencionou isso para o servidor 3. Seus backups serão em fita ou em um serviço de nuvem ou algum outro mecanismo off-line? Uma segunda cópia de arquivos no mesmo disco não é um backup.
- Não tenho ideia do que você está falando quando se refere a "permissões divididas", principalmente no contexto de crescimento e escalabilidade futuros.