Existem algumas maneiras de fazer isso:
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Pré-resposta com
debconf
executando o seguinte comando antes instalando:echo sun-java6-jdk shared/accepted-sun-dlj-v1-1 select true | \ /usr/bin/debconf-set-selections
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Use
expect
:#!/usr/bin/expect -f sudo apt-get -y install sun-java6-jre expect "[y/n]" sleep 1 send -- "yes\r"