Suponho que você esteja falando sobre uma configuração da Infraestrutura de área de trabalho virtual, em que as pessoas se conectam a várias máquinas virtuais em um servidor virtual central a partir de thin clients.
Os fatores mais significativos a serem considerados são usabilidade & flexibilidade. Se os seus usuários acharem difícil configurar ou usar uma configuração do Virtual Desktop, não importa se é um pouco mais barato.
Quanto ao custo, você pode descobrir que o custo da infraestrutura de servidor e rede certa para suportar um ambiente de VDI confiável e fiável não é barato (lembre-se de que, agora, se o seu PC cair, VOCÊ não poderá trabalhar, mas se o servidor VDI fica inativo em um ambiente VDI, então ninguém pode trabalhar, então você não pode cortar custos aqui) e não se esqueça do custo do próprio thin client VDI. Não é apenas um monitor, teclado e mouse.
Quanto à simplicidade, pode ser mais fácil para a pessoa que gerencia essas coisas, mas da perspectiva do usuário esse tipo de mudança será neutro ou uma desvantagem geral.