Sim, se você selecionar "Apagar disco e instalar o Ubuntu", isso excluirá todas as partições no disco inteiro e criará e formatará novas para o Ubuntu.
Isso é bom o suficiente para uso pessoal se você não precisar limpar todos os dados irrecuperavelmente por motivos de segurança / privacidade.
Se você sentir a necessidade de limpar seu disco com segurança, a maneira mais simples seria inicializar a partir de um DVD ou drive USB ao vivo, selecionar "Experimentar o Ubuntu sem instalar", abrir um terminal ( Ctrl + Alt + T ), verifique qual nome de dispositivo seu disco rígido deve ter usando o comando lsblk (deve ser algo como /dev/sda ) e, em seguida, sobrescreva a unidade completa com zeros usando o comando abaixo ( substituindo /dev/sdX pelo nome do disco que você quer limpar! ):
sudo dd if=/dev/zero of=/dev/sdX bs=4M status=progress
Isso vai demorar um pouco, dependendo do tamanho e da velocidade do seu disco. Depois disso, o disco se parece com o novo em fábrica, sem dados, partições ou mesmo tabelas de partições restantes.
Depois disso, você pode continuar instalando o Ubuntu normalmente.