Tente configurar uma página de status usando mod_status . Se você puder entrar depois de iniciar seu servidor, você deverá ver uma página como esta , que mostra cada conexão com seu vhost correspondente, e URL.
Se o seu site estiver tão sobrecarregado que você não possa entrar, tente executar netstat -nt | grep :80
ou lsof -ni tcp:80
para ver se um ou dois endereços estão inundando seu site e aplique iptables adequadamente.