A configuração do firewall é armazenada no registro
HKLM\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\SharedAccess\Parameters\FirewallPolicy\StandardProfile\
Ele pode ser exportado para backup ou se você fizer um backup do registro incluído nele.
Parece que, ao instalar o TFS, acabei de perder todas as configurações do Firewall do Windows.
Como posso fazer o backup e restaurá-los no Windows 2003?
Como o utilitário netsh.exe do Windows Vista / Windows Server 2008 permite (netsh advfirewall export) exportar / importar o Firewall do Windows com a configuração de segurança avançada.
Mas, para o Windows XP / Windows Server 2003, não há outras soluções [padrão] possíveis para essa tarefa, exceto as configurações do registro de exportação / importação como jer.salamon indicadas acima.