O modo mais simples de não usar o FTP é empurrar URLs HTTP na frente do seu urllist - ou substituí-lo completamente, como sebastionopilla disse. Você pode fazer isso dentro da shell cpan também:
o conf urllist unshift http://some.cpan.mirror/here/
Você pode usar
o conf urllist -
o conf urllist shift
para esvaziá-lo primeiro, se desejar.
Use
o conf no_proxy 1
para desativar o proxy.
Use
o conf commit
para salvar a configuração