O Red Hat é muito mais estável e estático comparado ao Ubuntu. Isso facilita o teste, e você não pode liberar o software que reivindica suporte para um sistema operacional sem testes extenuantes. Os fornecedores de software não suportarão oficialmente um sistema operacional ao qual não ofereçam suporte comercial.
Dito isso, se você for um lançamento de distro da mesma época que o lançamento da Red Hat, ele provavelmente funcionará perfeitamente. Eu modifiquei /etc/redhat-release muitas vezes para sobrescrever um instalador dizendo que ele não funcionaria quando eu sei perfeitamente que ele irá:)
Se você está procurando por algo FOSS, mas mantendo a compatibilidade garantida com a Red Hat, escolha o CentOS . São os recursos do Red Hat, que devem ser disponibilizados sob a GPL, recompilados sem a marca e o suporte da Red Hat Network.
Se você não tem nenhum pacote de software para se preocupar, escolha o que mais lhe convier.