Eu não olhei mais para isso, mas posso confirmar que isso é o que acontece - talvez devido aos níveis de service pack serem diferentes? (instância instalada sendo SP1 e o instalador da ferramenta não)
Acabei de usar o painel de controle e mudei o SQL 2008 instalado para remover a instância do serviço de banco de dados.
Em seguida, instalei a edição do MSSQL 2008 Express que inclui as ferramentas padrão - e a opção para o estúdio de gerenciamento estava lá para verificar ... não uma solução elegante, mas funcionou - então não me preocupei em descobrir o problema original.