Isso é mais provável porque o tipo MIME para Javascript é bastante contestado .
Tente adicionar application/javascript e text/x-js (assim como application/x-javascript )
Dito isso, uma maneira mais confiável pode ser filtrar com base na extensão do arquivo .js . Veja a diretiva Request_URI para mais informações ( link ) - isso pode não funcionar se você está usando URLs reescritos que não usam a extensão .js para arquivos JavaScript.
Se isso não funcionar, sua distro do Linux pode estar usando um tipo MIME completamente diferente para JavaScript. Localize a diretiva TypesConfig em seu arquivo de configuração e veja como ela está definindo o JavaScript. Em seguida, adicione esse tipo de MIME também.