Até onde eu sei, a resposta é não - certamente não há uma maneira padrão, já que há um bilhão de variantes diferentes de servidores DNS. Uma opção seria ter um registro 'masterdns.mydomain.com', garantido para conter o endereço IP do mestre (nem mesmo expor isso, não há necessidade) - então tudo que você precisa fazer é comparar o IP do Servidor DNS para o IP que lhe dá para o mestre, e está tudo pronto. Isso também é imperfeito, por causa do aliasing / multi-homing / whatever-the-hell (você não pode garantir que é um servidor diferente), mas ..
... você parece estar insinuando que está configurando tudo isso sozinho; nesse caso, você deve ter apenas o registro masterdns.mydomain.com.