Medir o tempo dentro de uma VM pode ser problemático, já que os processadores virtuais não são executados continuamente. Se você quiser ter uma visão clara do que realmente está acontecendo, use o Monitor de Desempenho no sistema operacional de gerenciamento. Procure pelo dispositivo de armazenamento virtual Hyper-V. Você também pode correlacionar isso com os dados do Monitor de Recursos para ver o que está concorrendo para o acesso aos discos.
Em geral, o tempo de resposta de um determinado VHD terá tudo a ver com o que mais está acontecendo no volume que hospeda esse VHD.