Eu tive o mesmo problema e finalmente resolvi isso esta manhã. Aqui está o que eu fiz:
Dê uma olhada no registro (todas as seções e chaves em HKEY_LOCAL_MACHINE \ SYSTEM \ CurrentControlSet \ services \ W32Time) no servidor com o problema de tempo e outro servidor membro que está sincronizando o ntp corretamente.
Encontrei algumas discrepâncias e exportei as chaves necessárias \ hives do servidor em funcionamento para o quebrado. As chaves a seguir foram desordenadas, aqui estão as boas chaves que eu exportei da caixa de trabalho para a que estava quebrada. Por favor, note que estes valores podem não ser os mesmos que os seus, por favor não use as chaves abaixo:
A seção de segurança estava faltando, então recriou com isso:
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\services\W32Time\Security]
"Security"=hex:01,00,04,80,84,00,00,00,90,00,00,00,00,00,00,00,14,00,00,00,02,\
00,70,00,05,00,00,00,00,00,14,00,fd,01,02,00,01,01,00,00,00,00,00,05,12,00,\
00,00,00,00,18,00,ff,01,0f,00,01,02,00,00,00,00,00,05,20,00,00,00,20,02,00,\
00,00,00,14,00,8d,01,02,00,01,01,00,00,00,00,00,05,04,00,00,00,00,00,14,00,\
8d,01,02,00,01,01,00,00,00,00,00,05,06,00,00,00,00,00,14,00,9d,01,02,00,01,\
01,00,00,00,00,00,05,13,00,00,00,01,01,00,00,00,00,00,05,12,00,00,00,01,01,\
00,00,00,00,00,05,12,00,00,00
E notou que a seção NtpServer tinha teclas ausentes, isso foi corrigido importando:
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\services\W32Time\TimeProviders\NtpServer]
"DllName"=hex(2):25,00,73,00,79,00,73,00,74,00,65,00,6d,00,72,00,6f,00,6f,00,\
74,00,25,00,5c,00,73,00,79,00,73,00,74,00,65,00,6d,00,33,00,32,00,5c,00,77,\
00,33,00,32,00,74,00,69,00,6d,00,65,00,2e,00,64,00,6c,00,6c,00,00,00
"Enabled"=dword:00000000
"InputProvider"=dword:00000000
"AllowNonstandardModeCombinations"=dword:00000001
"EventLogFlags"=dword:00000000
"ChainEntryTimeout"=dword:00000010
"ChainMaxEntries"=dword:00000080
"ChainMaxHostEntries"=dword:00000004
"ChainDisable"=dword:00000000
"ChainLoggingRate"=dword:0000001e
Em seguida, alterei as seguintes chaves existentes para reduzir a fase:
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\services\W32Time\Config]
"MaxAllowedPhaseOffset"=dword:00000001
"SpecialPollInterval"=dword:00000005
"SpecialInterval"=dword:00000001
Quando tiver certeza de que o registro está correto, emita os seguintes comandos via linha de comando como administrador:
w32tm /config /manualpeerlist:"YOURNTPSERVER-OR-DCHERE.YOURDOMAIN.COM,0x01" /syncfromflags:MANUAL /update
net stop w32time && net start w32time
w32tm /resync /computer:YOURNTPSERVER-OR-DCHERE.YOURDOMAIN.COM /rediscover
Aguarde alguns minutos e verifique a sincronização
w32tm /monitor /computers:YOURNTPSERVER-OR-DCHERE.YOURDOMAIN.COM
Deve ser parecido com isto:
YOURNTPSERVER-OR-DCHERE.YOURDOMAIN.COM[IPOFYOUR.NTP.OR.DC:123]:
ICMP: 0ms delay
NTP: +0.0496804s offset from local clock
RefID: YOURNTPSERVER-OR-PDCHERE [IPOFYOUR.NTP.OR.PDC]
Stratum: 3
Em seguida, verifique a fase:
w32tm /stripchart /computer:YOURNTPSERVER-OR-DCHERE.YOURDOMAIN.COM
Deveria ser assim:
10:08:42 d:+00.0000000s o:+00.0139224s [ * ]
10:08:44 d:+00.0000000s o:-00.0015659s [ * ]
10:08:46 d:+00.0000000s o:-00.0014534s [ * ]
10:08:48 d:+00.0000000s o:-00.0013418s [ * ]
10:08:50 d:+00.0000000s o:-00.0012421s [ * ]
Espero que isso ajude!