Os endereços dos servidores DNS de "backup" não são uma boa ideia e são a raiz do seu problema. Você poderia jogar jogos com um firewall de filtragem de pacotes para tentar "contornar", mas seria melhor usar o controlador de domínio apenas como servidor DNS para seus clientes.
Em geral, você nunca deve especificar servidores DNS em clientes do Active Directory que não sejam capazes de resolver os registros DNS do domínio do AD. Você obterá um desempenho não determinístico de logons, Diretiva de Grupo e / ou raízes DFS de Domínio em casos como esse tipo de configuração. Os clientes dependem strongmente do DNS para tomar as "decisões certas": trabalhar com o Active Directory.
Especifique apenas o servidor DNS do AD para seus clientes e tudo ficará bem. Se você estiver preocupado com o DNS estar "inativo", chame um controlador de domínio secundário e instale a função Servidor DNS nele. (Ter um segundo DC é uma apólice de seguro barata, de qualquer forma, e não é uma coisa ruim de se ter. Na minha experiência, no entanto, ter o servidor DNS do SBS "inoperante" provavelmente significa que você está tendo problemas muito maiores do que os clientes. para navegar em sites da Web.)