Tamanho menor do clusor significa que um arquivo será distribuído entre mais clusters (óbvios). Isso significa potencialmente mais fragmentação e possivelmente mais pesquisas para localizar os clusters. É a velocidade usual vs otimização de tamanho. Como os discos rígidos são baratos, eu preferiria tamanhos de clusters maiores, mas, de qualquer forma, você provavelmente não verá muita diferença ...