Se bem me lembro, o ADFS no 2012R2 só pode ser instalado em um farm, mesmo com apenas 1 nó (em oposição a um modo autônomo disponível nas versões anteriores). Se for esse o caso, você pode expandir seu farm adicionando nós adicionais. Se você usar o WID como seu armazenamento de dados, ele será replicado automaticamente. Se desejar, você pode definir um nó diferente para ser o armazenamento de dados principal. Você também pode usar esse processo para "mover" para outro servidor, decompondo o servidor antigo depois de fazer outro nó primário.
Tenha em mente que os farms baseados em WID podem ter no máximo 5 nós de servidor de federação (excluindo proxies).
Ou, se você quiser recriar e migrar, a Microsoft já tem um artigo para ele Migrando o servidor de federação do AD FS