Isso pode ser feito usando ACLs de grupo. Adicionando a seguinte linha ao seu arquivo de autenticação comum:
auth required pam_access.so
Irá configurá-lo. Você pode então usar um grupo (pode ser LDAP) para definir uma negação explícita. Inverta o significado para obter uma permissão explícita, que pode ser uma opção melhor se você não puder excluir alunos.
-:ALL EXCEPT root grp-retired-students:ALL EXCEPT LOCAL