Sim, você pode fazer isso com o módulo mod_rewrite . A entrada a seguir retornará uma resposta 403 Forbidden para clientes com o texto "Opera" ou "MSIE" em suas strings do agente do usuário, independentemente do caso do texto.
RewriteEngine on
RewriteCond %{HTTP_USER_AGENT} MSIE [NC,OR]
RewriteCond %{HTTP_USER_AGENT} Opera [NC]
RewriteRule ^.* - [F,L]
Se você preferir retornar 500 Internal Server Error, altere a F
para R=500
no final da diretiva RewriteRule.