Não há sentido na virtualização, a menos que você tenha uma razão muito específica para isso. O motivo pode ser, dando acesso root aos contêineres para várias pessoas e assim por diante.
Se tudo estiver sob seu controle, e você não precisar dar acesso a mais ninguém, eu desencorajaria qualquer tipo de virt, pois isso só aumenta o uso da CPU - a sobrecarga no caso de emulação baseada em contêiner não é muito, mas você precisa configurar o modo promíscuo para adaptadores de rede, o que aumenta o uso da CPU.
Muitos aplicativos podem se conectar através de sockets UNIX, o que seria vantajoso para evitar todo o problema do TCP. Do tamanho do servidor, eu acho que você comprou / alugou para algum propósito de desempenho sério.