Seu problema é que os modelos não permitem a personalização suficiente do SAN (Subject Alternative Name) ao usar a inscrição automática. Nesse caso, você precisa de outra caixa de seleção para Nome NetBIOS (ou Nome Abreviado de DNS).
Você basicamente tem duas escolhas. Continue usando a inscrição automática e lide com a necessidade de digitar o FQDN (que é uma boa prática de qualquer maneira). Ou você pode gerar manualmente os certificados e especificar os campos SAN adicionais que você precisa, como o nome NetBIOS (endereço IP, etc).