Faça um
<IfUser USER>
<Limit LOGIN>
Allow 17.13.3.0/24 47.73.1.0/24
DenyAll
</Limit>
</IfUser>
no seu /etc/proftpd/proftpd.conf.
E o usuário pode registrar apenas se vier da boa rede IP. Ou sem o IfUser para todos os usuários.
Talvez seja mais fácil colocar um firewall ...