Você não mencionou qual versão do Windows Server está sendo executada, mas se for 2008 ou posterior, será possível configurar o servidor DNS com um encaminhador . Isso é basicamente o servidor DNS upstream que o servidor de domínio encaminha todas as solicitações para as quais não é autoritativo.
Consulte este artigo da technet para um guia passo-a-passo.
A alteração das configurações de DNS no próprio servidor de domínio é uma ideia ruim . Os domínios do Windows dependem muito dos registros DNS para que o domínio seja (a) correto e atual e (b) atualizável pelos componentes relevantes para que os recursos do domínio possam ser localizados. Eu só mudaria o servidor DNS no controlador de domínio se eu fosse mover a função de servidor DNS da DC para uma caixa separada e dedicada.