Eu sei que este é um post antigo, mas estou usando isso e parece funcionar bem:
Adicionar filtro:
tc filter add dev eth1 parent 1: handle ::100 prio 1 protocol ip u32 match ip dst 10.10.10.10/32 flowid 1:100
Excluir filtro:
tc filter del dev eth1 parent 1: handle 800::100 prio 1 protocol ip u32
Basta alterar o número "100" para cada filtro necessário