Use uma ferramenta de construção de configuração, como o Puppet, que interpole as strings ou, se você não estiver disposto a adotar uma nova ferramenta, escreva um script de geração único na linguagem de sua escolha (perl, python, shell etc. .).
Você também pode usar arquivos comuns e include
instruções, conforme descrito em uma resposta à pergunta do StackOverflow, "configuração do subdomínio nginx ".