Instale os seguintes módulos:
sudo apt-get install libemail-outlook-message-perl libemail-localdelivery-perl
Quando instalado, faça o download do arquivo .pl chamado msgconvert.pl . executar:
./msgconvert.pl --mbox [desiredFilename].eml [currentFileName].msg
Agora você pode abrir seu arquivo .eml no thunderbird.
Referência :