O motivo mais comum em meu ambiente é que a conectividade de rede foi interrompida (na maioria dos casos, o usuário aciona o PC) ao carregar um perfil móvel e os arquivos críticos (o registro) ficaram corrompidos, tornando o perfil incapaz de carregar em tentativas subsequentes.
Uma ACL fará isso, se o usuário não conseguir carregar o perfil nesse diretório (acesso negado).
OMI, a corrupção é o candidato mais provável.
Em qualquer caso: isso não deve ser um problema. Se você tiver scripts ou aplicativos que dependem do perfil de usuário que residem em um local específico, eles estão quebrados e precisam ser corrigidos. Eu entendo a implementação de uma solução alternativa, mas ainda assim, tente corrigir o problema.