Estou tendo o mesmo problema com o Server 2008. Postei uma pergunta detalhada aqui Windows Server 2008 ignora a rota persistente com menor métrica .
Parece que a Microsoft seguiu seu próprio caminho quando redesenhou sua nova implementação de pilha TCP.
A solução proposta pelo suporte técnico da Microsoft é definir a placa de rede para ignorar todas as regras de roteamento padrão e recriar todas as regras de roteamento manualmente como rotas persistentes. É uma droga, mas essa pode ser a única opção.
Para ignorar rotas padrão:
netsh interface ipv4 set interface [ID] ignoredefaultroutes=enabled
Para obter o ID da sua NIC:
netsh interface ipv4 show interface