Parece que o problema ao qual você se vinculou era menos relacionado à "nuvem", e mais aos administradores que precisavam monitorar o site e definir permissões e limites adequados. Eu uso o Rackspace Cloud Sites para algumas das minhas coisas, e se você quiser, pode limitar o escalonamento do ciclo de computação.
Se você estiver migrando para um ambiente como o Cloud Sites, um sistema sem shell no qual você envia seu código, não há realmente nenhuma consideração especial em relação à "nuvem", contanto que você esteja usando tecnologias suportadas (que para elas é PHP, Perl, .NET, Python (eu acho), MSSQL, MySQL).
Será muito semelhante do ponto de vista da sua pergunta a hospedagem em um provedor compartilhado típico, exceto pelo fato de que você tem um conjunto discreto de poder de computação garantido pelo qual pagou e que a capacidade pode ser ampliada de forma mais flexível através da "nuvem" (ou seja, clusters escaláveis), se necessário.