I'm guessing that the Sqlite driver can't properly lock the file over SMB/CIFS hence the issues.
Exatamente certo, embora também afete o AFP e seja aparentemente específico para certas versões da biblioteca sqlite. A Adobe é um ofensor comum quando se trata de qualquer coisa relacionada a residências de rede e resolvemos isso com o método de links simbólicos (geralmente o diretório de preferências específicas, em vez de arquivos individuais).
É uma solução bastante confusa, pois é apenas uma correção para usuários individuais em máquinas individuais. Também gostaríamos de saber se alguém criou uma abordagem mais elegante.