O único motivo para ter um namespace separado é porque você não tem controle sobre o outro namespace DNS OU tem a necessidade de separar o controle do outro namespace, enquanto mantém o controle sobre os objetos do AD em ambos. O problema com namespaces disjuntos é que a maioria (se não todos os aplicativos que reconhecem o AD) usam a suposição de que o sufixo UPN será o mesmo para todos os usuários.