Se você tiver nomes DNS sobrepostos ou Nomes de NETBios, a maioria das ferramentas de migração não funcionará. O migrador SmartAD do BinaryTree provavelmente pode lidar com esse cenário - não acredito que o QMM possa, como Jay recomendou em outra resposta.
A ferramenta BinaryTree tem algumas verrugas significativas e não é uma ótima ferramenta, mas você é bastante limitado em suas escolhas com os nomes de domínio sobrepostos.