Como desativar o arquivo de grupo local (para sempre)?
Esta não é uma boa idéia (tm). As tentativas de fazer isso seriam muito "impactantes"
Ou há alguma outra solução alternativa? Você menciona o seguinte, que soa como isso ocorre sempre que os servidores são corrigidos e reinicializados. "... sempre que um pacote é atualizado e tem algo a ver com grupos ..."
Uma solução "menos impactante" seria criar um script init personalizado para remover o grupo staff
de /etc/group
quando o sistema alterasse os níveis de execução (exatamente quais deles dependem do procedimento usado para corrigir o problema servidores)
Veja a documentação Debian em seus init-scripts para detalhes .