A única maneira de ver isso acontecendo é se você instalou o Active Directory junto com o DNS. Quando você tem um servidor DNS integrado ao Active Directory, ele não pode inicializar a partir de um arquivo. Tem que ficar integrado ao AD. Você pode clicar nas propriedades de cada zona e alterá-las de "integradas ao Active Directory" ao padrão e tentar novamente, mas considere o efeito adverso que teria no AD. Talvez você não tenha pretendido instalar o AD em primeiro lugar, mas apenas o DNS?