O problema era que o cartão estava fazendo algum tipo de detecção de transmissão automática em ttyS4 (que tinha um cabo conectado), mas não no ttyS5 (o que não aconteceu).
Eu joguei o cartão fora e estou usando um adaptador USB agora.
Eu tenho uma nova placa serial PCI, sendo usada em uma caixa do Ubuntu 14.04.
As portas seriais são mostradas como / dev / ttyS4 e / dev / ttyS5.
$ dmesg | grep ttyS
[ 0.732690] 00:03: ttyS0 at I/O 0x3f8 (irq = 4, base_baud = 115200) is a 16550A
[ 0.733604] 0000:06:04.0: ttyS4 at I/O 0xd010 (irq = 16, base_baud = 115200) is a XScale
[ 0.733700] 0000:06:04.0: ttyS5 at I/O 0xd000 (irq = 16, base_baud = 115200) is a XScale
$
Eu posso definir a taxa de transmissão de ttyS4 uma vez após a reinicialização ...
$ sudo /bin/stty -F /dev/ttyS4 115200
$
Uma segunda tentativa produz um erro ...
$ sudo /bin/stty -F /dev/ttyS4 115200
/bin/stty: /dev/ttyS4: Input/output error
$
ttyS5 funciona bem ...
$ sudo /bin/stty -F /dev/ttyS5 115200
$
e uma segunda vez ...
$ sudo /bin/stty -F /dev/ttyS5 115200
$