Encontramos o problema. Criei os novos contadores e os adicionei a um coletor de dados existente na interface do PerfMon, mas o aplicativo ainda não havia criado nenhuma instância. Portanto, os contadores que adicionei foram definidos como "\ MyApp: Perf \ *" em vez de "\ MyApp: Perf () \ ".
Agora que o aplicativo registra dados há algum tempo, removi e adicionei novamente os contadores e eles trabalharam dessa vez. Tenho certeza de que, se eu usasse o logman para criar o conjunto de coletores de dados com "\ MyApp: Perf () \ " especificado explicitamente, isso também funcionaria.