Uma sugestão ou duas ... tente usar o robocopy .. e diga para ignorar a segurança / COPY: DAT, isso "deve" permitir que os arquivos sejam copiados e herdam as permissões com base nas pastas pai. O problema quando eu fiz isso foi o administrador anterior tinha definido permissões para o usuário nas pastas filho e acabei voltando e tendo que redefini-las manualmente.
Outra opção é roteirizar. Se você tiver milhares de usuários para mover e souber que precisa redefinir as ACLs, os icacls seriam um caminho a ser seguido. Faça com que o script copie os dados dos usuários e faça com que o script redefina as permissões para você.
Mas é mais do que provável que você precise abandonar a GUI um pouco para tornar isso mais fácil para você.