Sim, os controladores de domínio devem ser os Navegadores principais - definindo seus controladores de domínio como "Preferred Master " deve corrigir a maior parte do problema de eleição do Navegador Mestre.
Um dos motivos mais comuns para operar um servidor WINS é fornecer uma referência central para nomes NetBIOS em várias sub-redes. Escolher um servidor WINS primário e apontar todos os clientes para ele permite que a resolução de nomes NetBIOS funcione em sub-redes sem exigir o uso de controladores de domínio.
Mas se o seu sistema deve depender de controladores de domínio, a perda de replicação do site C pode explicar seus sintomas. Então comece com confirmando a replicação bem sucedida .