Você afirma que as cópias dos arquivos parecem estar corretas, mas isso não significa realmente que tudo está saudável no nível físico, apenas que os problemas não afetam significativamente a cópia. É provável que isso signifique que a rede subjacente está OK, mas você deve confirmar isso.
Execute Netstat -e em uma janela de comando para ter uma ideia rápida se houver problemas na camada física. Idealmente, o Netstat não reportará erros ou descartes. Você pode ver alguns relacionados a conexões / desconexões de rede válidas (físicas), mas nunca deve haver muitas delas.
Se você está vendo muito (muitos 10 e acima), então você tem um problema de nível baixo (no nível do driver do dispositivo, duplex e outras configurações de parâmetro NIC, físico nic, cabo, switch port ou switch) e deve focar esforços lá antes de passar para as partes mais complicadas da pilha de rede.