Raramente é possível suposições "seguras" sobre qualquer coisa. Entenda a rede e o software que você está implantando nele.
É muito incomum desabilitar o IPv4 ao nível de desinstalação. Isso é evidente quando isso acontece, quebra a pilha de rede de vários softwares completamente, onde as funções de rede não poderiam funcionar.
Você ainda pode tentar o seu software com o IPv6 somente endereçando para ver se alguma coisa quebra.
Para o listener de loopback, tente usar uma constante no ambiente de programação que suporte ambos. Para Java, isso pode ser InetAddress.getLoopbackAddress ()