Isto é quase certamente devido aos diferentes tipos de URLs relativos.
De acordo com o link
A directory called .. (two periods) in a relative URL indicates the parent directory, essentially stripping off everything up to the previous slash in the the Base URI. Note that this only has meaning inside the pathname, so you cannot use this notation to go up higher than the root directory.
A directory called . (one period) refers to the current directory.
A relative URL that begins with / (a slash) always replaces the entire pathname of the base URL.
A relative URL that begins with // (two slashes) always replaces everything from the hostname onwards.
Assim, um URL relativo que faça "/ wp-admin" substituirá toda a base conforme você está passando. Você quer que ele seja substituído por "./wp-admin" para que não seja reescrito tudo.
Quanto a realmente mudar isso, não tenho certeza, mas suspeito que você precisará alterá-lo no lado do wordpress.