A remoção do Windows excluirá TODOS os softwares do Windows. Então, essa é uma empresa SIM para sua pergunta.
Você pode limpar todo o seu disco (e todos os itens relacionados ao Windows) durante a instalação do Ubuntu, portanto, é necessário fazer qualquer coisa especial antecipadamente ou após a instalação. Em algum momento, ele perguntará o que fazer com o layout do disco (por exemplo, particionamento). Se você escolher "limpe o disco", ele fará isso para você (você também pode fazer isso com a opção "algo mais", mas isso exigiria que você entendesse como alterar manualmente suas partições. Pode ser um pouco demais para um novo usuário).