Esta questão fornece alguns detalhes sobre a sequência de login.
A autenticação é feita pelo PAM (módulos de autenticação conectáveis). Uma breve pesquisa não revela nenhuma implementação existente dessa ideia (ou, pelo menos, não faz parte da configuração padrão do Ubuntu - não ficaria surpreso se alguém, em algum lugar, tivesse feito isso).
Esta mensagem implica que seria possível alterar o usuário durante a processo de autenticação, e presumivelmente, portanto, poderíamos escrever um módulo PAM que verificasse várias senhas e mudasse o usuário finalmente conectado apropriadamente. No entanto, você precisará fazer um trabalho de desenvolvimento bem difícil.
Se sua intenção é criar um usuário "oculto", você precisará fazer muito mais trabalho para esconder a existência do usuário oculto além de apenas brincar com a sequência de login - mudando onde o $HOME está armazenado, o que acontece no log de autenticação, ocultando o fato de que uma verificação do sistema mostraria a sequência de login modificada, etc, etc.