Se a sua conta root não estiver desativada, você poderá se tornar root:
su -
Depois disso, você poderá alterar a propriedade de / usr novamente.
Se isso não funcionar (porque você não habilitou uma conta root + senha), você pode inicializar a partir de um live cd (um pendrive ou CD que você ainda possa ter em sua instalação do Ubuntu funcionará).
Inicialize e monte seu disco rígido atual (talvez em / media / raring-root-disk). Em seguida, altere a propriedade dessa partição montada:
chown -R root:root /media/raring-root-disk/usr
chmod -R a+rX /media/raring-root-disk/usr
Nota: eu não testei isso, então a abordagem de live-CD (embora favorecida por mim) pode não funcionar. No entanto, não consigo ver como isso pode prejudicar sua situação. Certifique-se de ter backups, pois você pode precisar deles de qualquer maneira se achar que vai reinstalar tudo isso ...