Eu usaria o Apache com o mod_mono pois o fastcgi-mono-server2 para o nginx provavelmente ainda está causando debulha . Existem também alguns bugs abertos (sobre vazamentos de memória, se bem me lembro) em relação ao servidor mono fastcgi e é sugerido usar o Apache ao invés do nginx.
EDITAR:
Thrashing: Eu mesmo testei com o antigo release 2.4 se bem me lembro (não tenho certeza se versões mais recentes sofrem do mesmo problema). Aqui é um artigo que menciona isso.
Other problem we had was the mono web process and the resources it used. Going to 600-900Mb RAM and wasting a lot of CPU, even at idle time.
Estes dois bugs são possíveis vazamentos de memória ao usar o fastcgi-mono-server.