O comentário do azat resolveu meu problema.
Eu tenho um servidor que eu ssh para a partir do Windows 7 usando Cygwin + mintty. No servidor, conecto a uma sessão do tmux. Até aí tudo bem, mas quando tento alterar o layout do tmux usando C ^ b [seta] e C ^ b M ^ [seta] recebo problemas.
Algumas vezes funciona, como nas alterações de layout, mas na maioria das vezes o código para a tecla pressionada é impresso no shell da seguinte maneira:
usuário @ servidor > [1; 5D
Isso é para C ^ b C ^ left. Geralmente funciona pela primeira vez, mas todas as tentativas a seguir imprimem o código. Então, há alguma maneira de corrigir isso para o Cygwin? (como eu não tenho esse problema quando eu ssh de uma máquina linux).