Depois de encontrar os limites do software RAID no w2k3, passamos para o RAID de hardware. Não tentei entrar no W2K8. IIRC o problema que encontramos é o software raid é apenas para 'proteção de dados', de acordo com o artigo da KB. O segundo disco não será para inicialização sozinho, você teve que pular alguns loops com registros de inicialização.
Temos bons contratos de locação / compra de cartões RAID a preços baixos, apenas recebemos os nomes bem conhecidos. A invasão de hardware fará isso corretamente e suportará hot swapping. A invasão de software foi muito difícil.