Talvez você tenha encontrado um bug?
Outra maneira de fazer a mesma coisa (imagine se isso funciona para você?):
scp -oIdentityFile=/Users/emmie/Desktop/Blocks/blocks_key.pem ~/Desktop/Blocks/code/www/uploadtest.html [email protected]:/var/www
Além disso, pode ajudar (apenas curioso) se você publicar a saída de:
stat /Users/emmie/Desktop/Blocks/blocks_key.pem